Ендрю Кернан колись був біологом, але його шлях привів до священства та ордену єзуїтів. Тепер він мандрує світом, досліджуючи релігійні дива. В Бразилії, у селі Біло-Квінто, Ендрю стає свідком незвичайного явища: статуя Діви Марії Гваделупської плаче на похоронах святого Паули Аламейди, людини, яка мала стигмати — кровоточиві рани, що з'явились на її тілі. На руці паули були незвичайні чотки, які потрапляють до Кернана. В історії «Стигмати» маленький хлопчик краде ці чотки та продає їх жінці на ринку. Вона надсилає їх своїй дочці Френкі Пейдж, перукарці з Піттсбурга. Незабаром у Френкі також з’являються стигмати, що привертає увагу місцевого священика Дарнінга. Він терміново звертається до Ватикану, і до Піттсбурга прибуває батько Ендрю. Він усвідомлює, що дух Аламейди відродився, щоб кинути виклик основам католицизму, проголошуючи, що Ісус не прагнув будівництва церков. Кардинал Даніель Хаусеман, бачачи загрозу, що це може підірвати довіру до церкви, вирішує розправитися з Френкі т...