Мультфільм "Анастасія" розпочинається під час святкування 300-річчя династії Романових, коли на порозі героїчної історії з'являється чаклун Распутін. Його темна магія спричиняє лихо для царської родини, і на горизонті вже нависає революція. Щоб врятувати свою внучку Анастасію, дочка останнього імператора Миколи II, бабуся Марія Федорівна вирішує перевезти її за кордон. Проте, у момент втечі, дівчинка шукає підтримки, та не встигає — падає зі сходів, й так і не покидає Росію. Протягом десяти років Анастасія живе в дитячому будинку, не пам’ятаючи свого минулого, за єдиний зв'язок з ним тримаючи кулон, що його подарувала бабуся. Тим часом у Парижі Марія Федорівна об’являє винагороду за підказки про внучку, що примушує до дій двох молодих чоловіків, Володимира і Дмитра. Виглядає, що у Анастасії з’являється шанс повернутися до рідних, але темна тінь Распутіна знову нависає над її долею…